probiers doch einfach mit bissel nachstellen ?
Wenns gleich is wie bei der MKIII bzw wie bei fast jedem anderen auto haste ja an der B Säule den "bügel" wo das schloss einrastet. Der ist mit zwei schrauben befestigt. Beide leicht lösen und den Bügel ganz wenig nach innen drücken, festschrauben und sollange probieren bis die Tür gut schliesst.
Und wichtig: Wenig ist oft mehr da

es sind wohl nur paar milimeter die du am bügel verstellen musst, also nicht gleich ganz lösen und 1cm rüberschieben

sonst findest nie wieder die richtige position...